Yapımından Sonraki Değişiklikler
1552-1572 yıllarında Mimar Sinan tarafından kapsamlı şekilde yeniden inşa edildi.
II. Mahmut döneminde (1837) geniş çaplı yenilendi, bu yenilemeye dair kitabe Yesarizade Mustafa İzzet Efendi tarafından yazılmıştır.
1965 ve 2010-2013 yıllarında Zeytinburnu Belediyesi tarafından kapsamlı restorasyonlarla bugünkü halini aldı.
Öne Çıkan Özellikler
Kagir yapıda, kare planlı ve ahşap çatılı, tek şerefeli minareye sahip bir camidir.
Merkez Efendi’nin ibadet ve inziva için kullandığı çilehane bölümünde 30 metrekarelik, küçük kapılı ve dar pencereli bir yapı, kuyu üzerinde konumlandırılmıştır.
Harem binası bugün Türk Dünyası Belediyeler Birliği merkez binası olarak kullanılmaktadır.
Merkez Efendi, tasavvufi kimliğinin yanı sıra halk arasında Kanuni Sultan Süleyman’ın annesi Hafsa Sultan’ın tedavisi için 41 baharattan Mesir Macunu yapmasıyla da tanınmaktadır.
