Yapımından Sonraki Değişiklikler
Uzun yıllar harap durumda kalmıştır.
1969 yılında kapsamlı bir onarımdan geçerek minaresi yeniden inşa edilmiştir.
1997 yılında bir restorasyon daha görmüş ve günümüzdeki halini almıştır.
Öne Çıkan Özellikler
Fevkani (yükseltilmiş) olarak inşa edilmiştir ve 466 m²’lik bir iç alana sahiptir.
Tek şerefeli tuğla minaresi ve son cemaat yeri bulunmaktadır.
Son cemaat yerinin üst katı iç mahfil olarak harime dahil edilmiştir. Kadınlar mahfili, ahşap bir kafesle ayrılmıştır.
Caminin iç yapısına 11 basamakla çıkılmaktadır. Tavan, mihrap, minber ve kürsü tamamen ahşap malzemeyle yapılmıştır.
Duvar kalınlığı 65 cm’dir; sağlam bir yapıya sahiptir.
Sekbanbaşı Yakup Ağa Camii, Osmanlı’nın erken dönem fetih camilerinden biri olup, özellikle yüksek yapısı ve altında bulunan dükkânları ile dikkat çeker. Bânisi Yakup Ağa, Hadikat’ül Cevami’ye göre Aksaray’daki zaviyesinde medfundur.
